Терминология ДНК-генеалогии

Клады – 19 основных мутационных кластеров в хромосоме. Порядок букв (от А до Т) отражает последовательность возникновения мутаций. Клады разветвляются на гаплогруппы, которые нумеруются цифрами и буквами.

Гаплогруппа – генеалогическая общность людей, несущих одну потомственную характерную метку в ДНК.

Субклады – ветви гаплогрупп.

Локус (маркёр) – участок хромосомы.

Снип (SNP) – практически необратимая мутация в ДНК.

Терминальный снип – последний из определенных в ряду снипов.

Аллели – число повторов нуклеотидов в хромосоме (число повторов определенных нуклеотидных последовательностей в каждом маркере).

мтДНК гаплогруппы H – у 40% всех европейцев, в том числе у славян (20-30 тысяч лет назад).

Западно-евразийские митохондриальные гаплогруппы – HV, J, U, T, K.

Азиатские (восточные, восточно-евразийские) митохондриальные гаплогруппы (мтДНК) – A, C, D, G.

KLIN – KLyosov Interpretation – открытая научная база гаплотипов.

CTS и VL (первое обозначение – Chris Tyler-Smith, руководитель английской генетической лаборатории, второе означает Vladimir Volkov, Томский университет)

DYS – «ДНК Y Сегмент» (DNA Y Segment).

ISOGG – Международная Ассоциация генетической генеалогии – International Society of Genetic Genealogy - httpwww.isogg.org/tree/

Генеалогический анализ Y хромосомы — это определение числа повторов в каждом маркере (STR) и выявление присущих вам снипов (SNP).

Все 46 хромосом, 23 пары, в совокупности состоят из трех миллиардов нуклеотидов, и в их составе примерно 30 тысяч генов. Стало быть, в среднем по 65 миллионов нуклеотидов и по 652 гена на хромосому. Хромосома Y состоит из 50 миллионов нуклеотидов, и в ней всего 27 генов. Остальная часть — некодирующая, «никчемная». Оказалось, в этой «никчемной» части имеются некие загадочные повторы нуклеотидов.

И гаплогруппы, и субклады определяются необратимыми мутациями в Y-хромосоме, снип-мутациями, в отличие от обратимых мутаций, стир-мутаций, в гаплотипах (тех самых повторов, что описаны выше, которые в научной литературе называют STR, от Short Tandem Repeats). Эти снип-мутации (от сокращения SNP, Single Nucleotide Polymorphism), стараются подобрать такие (для идентификации гаплогрупп и субкладов), которые были бы стабильными за все время существования человечества. Поэтому гаплогруппы и субклады стабильны, не меняются во времени.

Снип-мутации – это практически необратимые мутации в ДНК (от английского сокращения SNP, что означает «однонуклеотидные вариации»). Они – практически вечные. Раз появившись, они уже не исчезают.

Мутации, которые интересуют генетическую генеалогию, бывают двух типов – или изменение числа повторов, тандемов (STR - Short Tandem Repeats.), или «точечные», однонуклеотидные (SNP – Single Nucleotide Polymorphism). И вот оказалось, что многие повторы нуклеотидов находятся у разных людей в одних и тех же участках Y-хромосомы. Эти участки биохимиками уже пронумерованы, классифицированы и сведены в списки. Они получили название «маркеры». Набор маркеров, точнее, повторов в них, называется «гаплотип». Уже известных маркеров многие сотни. И они, как правило, одни и те же у всех людей на Земле. Отличаются только числом повторов, что вызвано теми самыми ошибками ферментов при копировании из поколения в поколение.

Мутация в каждом маркере в среднем происходит раз в 14 тысяч лет, но в гаплотипах, то есть определенных наборах маркеров, мутации происходят со следующими средними скоростями:

– в 6-маркерном гаплотипе она происходит (на весь гаплотип) в среднем раз в 135 условных поколений, или раз в 3380 лет (в этом коротком гаплотипе маркеры мутируют более медленно, чем в других гаплотипах),

– в 12-маркерном – раз в 50 поколений, или в 1250 лет,

– в 25-маркерном – раз в 22 поколения, или в 550 лет,

– в 37-маркерном – раз в 11 поколений, или в 275 лет,

– в 67-маркерном – раз в 8 поколений, или в 200 лет,

– в 111-маркерном – раз в 5 поколений, или в 125 лет,

– в 431-маркерном гаплотипе – примерно раз в поколение, или, точнее, раз в 33 года.

Источник

Категория: Зорба | Добавил: i_balaev (13.11.2019)
Просмотров: 19
Всего комментариев: 0
avatar